Desarrollar la capacidad para la formulación, seguimiento y evaluación de las políticas, planes, programas y presupuestos en los integrantes del sistema nacional de Salud.

Generar información útil para la toma de decisiones oportunas para la conducción del sector salud

 Definir las normativas legales y trazar los lineamientos para su aplicación con la finalidad de regular el funcionamiento del Sistema Nacional de Salud.

Desarrollar un programa de organización operacional y estructural interno que permita lograr efectividad y eficiencia en el cumplimiento de sus funciones.

 Impulsar el fortalecimiento institucional de la SESPAS mediante la transferencia de técnicas y metodologías para mejorar el desempeño en el ejercicio de la rectoría.